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个人转让股权，以股权转让收入减除股权原值和合理费用后的余额为应纳税所得额，按“财产转让所得”缴纳个人所得税。合理费用是指股权转让时按照规定支付的有关税费。
即：应纳税额=应纳税所得额×税率=（收入总额-财产原值-合理费用）×20%.所以计算股权转让所得税的关键是确定股权转让收入和股权原值。
（一）股权转让收入的概念及确定方法股权转让收入是指转让方因股权转让而获得的现金、实物、有价证券和其他形式的经济利益。转让方取得与股权转让相关的各种款项，包括违约金、补偿金以及其他名目的款项、资产、权益等，均应当并入股权转让收入。纳税人按照合同约定，在满足约定条件后取得的后续收入，应当作为股权转让收入。
符合下列情形之一的，主管税务机关可以核定股权转让收入：
1、申报的股权转让收入明显偏低且无正当理由的； 2、未按照规定期限办理纳税申报，经税务机关责令限期申报，逾期仍不申报的； 3、转让方无法提供或拒不提供股权转让收入的有关资料； 4、其他应核定股权转让收入的情形 （二）如何确定股权原值通常情况下，股权原值按照纳税人取得股权时的实际支出进行确认。如纳税人在获得股权时，转让方已经被核定征收过个人所得税的，纳税人在此次转让时，股权原值可以按照取得股权时发生的合理税费与税务机关核定的转让方股权转让收入之和确定。这也是为了使整个转让环节前后衔接，避免重复征税。
对自然人多次取得同一被投资企业股权的，转让部分股权时，采用“加权平均法”确定其股权原值。
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