问：在研发费加计扣除时，公司为研发人员代扣代缴的三险一金（即员工个人承担的部分）能否计入研发费加计扣除？
答：《国家税务总局关于印发〈企业研究开发费用税前扣除管理办法（试行）〉的通知》（国税发〔2008〕116号）第四条第（三）项规定，在职直接从事研发活动人员的工资、薪金、奖金、津贴、补贴，允许在计算应纳税所得额时按照规定实行加计扣除。
《国家税务总局关于企业工资薪金及职工福利费扣除问题的通知》（国税函〔2009〕3号）第二条“关于工资薪金总额问题”规定，《实施条例》第四十、四十一、四十二条所称的“工资薪金总额”，是指企业按照本通知*9条规定实际发放的工资薪金总和，不包括企业的职工福利费、职工教育经费、工会经费以及养老保险费、医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费等社会保险费和住房公积金。属于国有性质的企业，其工资薪金，不得超过政府有关部门给予的限定数额；超过部分，不得计入企业工资薪金总额，也不得在计算企业应纳税所得额时扣除。
根据上述规定，个人承担的三险一金部分构成职工“工资薪金总额”，企业履行的是代扣并向社会保险部门代缴的义务，在职直接从事研发活动人员承担的三险一金部分，可以在计算应纳税所得额时按照规定实行加计扣除。