问：公司注销时，有100多万元的进项税额由于时间滞后的原因未及时抵扣，存货已全部销售完毕，该部分进项税能否申请退还？
答：《财政部、国家税务总局关于增值税若干政策的通知》（财税〔2005〕165号）第六条关于一般纳税人注销时存货及留抵税额处理问题中规定，一般纳税人注销或被取消辅导期一般纳税人资格，转为小规模纳税人时，其存货不作进项税额转出处理，其留抵税额也不予以退税。
根据上述规定，一般纳税人注销，其留抵税额不予以退税。