问：浙江有一外资企业A，在上海设立分公司B，B为研发机构，非独立核算，只有费用无销售收入，请问：B公司所发生的费用是否可以纳入A公司统一做帐核算，被稽查的话有哪些风险？
答：《中华人民共和国企业所得税法》第五十条规定，除税收法律、行政法规另有规定外，居民企业以企业登记注册地为纳税地点；但登记注册地在境外的，以实际管理机构所在地为纳税地点。居民企业在中国境内设立不具有法人资格的营业机构的，应当汇总计算并缴纳企业所得税。据此，设在异地研发的部门，非独立核算，只有费用无销售收入，那么所发生的费用是可以与A公司法人单位实行汇总计算并缴纳企业所得税。
再问：分公司B在上海进行了工商和税务登记，登记内容为销售所属公司生产的电子产品，企业名称：***公司分公司，实际上只有研发，为了在那边留住一些高科技人才所设，销售只是通过分公司发给客户，生产和销售均是总公司，我们现在已经在一起核算，发票抬头全部开在总公司，但是部份付款是通过分公司付出去的.现在税务部门要求我们分开核算，请问：我们总公司的费用是否可以委托分公司代付？如何来区分总分公司的费用？
答：分公司采取非独立核算的，那么均由总公司开具发票，章也是总公司的，所有的往来都与总公司发生关系，分公司只是以总公司的名义招览客户而已，特别是有资质才能经营的项目。所以，总公司的费用可以委托分公司代付，没有必要区分总分公司的费用。