财政部、国家税务总局发布的《关于企业重组业务企业所得税处理若干问题的通知》（财税[2009]59号）文件，首次明确了新税法下企业债务重组业务的所得税处理方法，并根据债务重组的不同情形，分别明确了一般性税务处理和特殊性税务处理政策。债务重组业务适用不同的所得税处理政策，其与会计处理也存在着不同的差异。以下我们就债务重组业务一般性税务处理与会计处理的差异作一下分析：
一、债务重组业务一般性税务处理政策根据财税[2009]59号文，企业债务重组业务一般性税务处理应按以下规定进行：1、以非货币资产清偿债务，应当分解为转让相关非货币性资产、按非货币性资产公允价值清偿债务两项业务，确认相关资产的所得或损失；2、发生债权转股权的，应当分解为债务清偿和股权投资两项业务，确认有关债务清偿所得或损失；3、债务人应当按照支付的债务清偿额低于债务计税基础的差额，确认债务重组所得，同时债权人应当按照收到的债务清偿额低于债权计税基础的差额，确认债务重组损失；4、债务人的相关所得税纳税事项原则上保持不变。
二、债务重组业务一般性税务处理与会计处理差异债务重组业务一般性税务处理方法与会计准则基本一致，但仍存在一定差异：
（一）、重组债权、债务以及相关资产的账面价值与计税基础不一致时，债权人、债务人的会计与税务处理将出现差异。
这是因为债权人、债务人的债务重组损失或利得以及资产转让收益会计上是以重组债权、债务及相关资产的账面价值进行计量的，而税法上以重组债权、债务及相关资产的计税基础进行计量。
例1：甲公司欠乙公司货款100万元。由于甲公司财务发生困难，经双方协商，甲公司以其自产产品偿还债务。该产品账面价值55万元（账面余额60万元，已计提减值准备5万元），公允价值60万元。乙公司已对该债权计提减值准备5万元。甲、乙公司均为增值税一般纳税人，适用增值税税率17%，所得税率25%.
1、会计处理（1）甲公司：
借：应付账款　1000000
贷：主营业务收入
600000
应交税费—应交增值税（销项税额）　102000
营业外收入（债务重组利得）　298000
借：主营业务成本 550000
存货跌价准备 50000
贷：库存商品　600000
甲公司用于偿债的产品账面价值55万元，计税基础60万元，计提存货跌价准备时产生可抵扣暂时性差异5万元（60－55），如果当时已确认了递延所得税资产1.25万元（5×25%），结转存货跌价准备时应予转回：
借：所得税费用
12500
贷：递延所得税资产 12500
（2）乙公司：
借：库存商品　600000
应交税费—应交增值税（进项税额）　102000
坏账准备　50000
营业外支出（债务重组损失）248000
贷：应收账款　1000000
债务重组前该项应收账款坏账准备账面价值为5万元，计税基础为0，如果以前已确认递延所得税资产1.25万元（5×25%），结转该项坏账准备后应转回已确认的递延所得税资产：
借：所得税费用　12500
贷：递延所得税资产
12500
2、税务处理
（1）甲公司：由于重组债务的账面价值与计税基础相同，因此税法上确认的债务重组所得与会计一致，为29.8万元；转让库存商品的计税基础为60，税法上应确认资产转让所得0元（60－60），而会计上确认的资产转让收益5万元（60－55），应调减应纳税所得额5万元。
（2）乙公司重组债权计税基础为100万元，税法上应确认债务重组损失29.8万元（100－60－10.2），而会计上确认的债务重组损失为24.8万元，应调减应纳税所得额5万元。
（二）、修改其他债务条件时，根据是否附或有条件，债权人与债务人的会计与税务处理也会存在不同的差异：不附或有条件时，一般情况下会计与税务处理基本一致，但如果重组后应收、应付金额超过了正常信用期，会计上的公允价值应考虑货币时间价值进行折现，而税法上仍应按终值确认；附或有条件时，债权人根据谨慎性原则对或有应收金额不予确认，其会计与税务处理与不附或有条件时一致；而债务人的或有应付金额若符合或有事项准则中预计负债确认条件的，应将其确认为预计负债。
税法上，由于只有实际发生的与取得收入有关的、合理的支出才可在计算应纳税所得额时扣除，因此预计负债确认时不得在税前扣除，只有实际发生时才能扣除。
例2、丙公司2008年6月份购买乙公司产品价款50万元，丙公司签发一张期限为6个月、票面年利率为5%的商业承兑汇票。票据到期日，本息合计51.25万元，由于丙公司无法偿还票据本息，2009年1月经双方协定，延长偿还期限至2010年12月31日，本金降为40万元，免除已欠利息，利率降至3%，但如果丙公司2009年盈利，则利率仍为5%.丙公司适用所得税率25%.
1、债务重组日丙公司会计与税务处理。债务重组日，丙公司应确认预计负债1.6万元[40万元×（5%－3%）×2]：
借：应付票据　512500
贷：应付账款　400000
预计负债　16000
营业外收入（债务重组利得）　96500
而税法上应确认债务重组所得11.25万元（51.25－40），应调增应纳税所得额1.6万元（11.25－9.65）。
预计负债计税基础＝账面价值－未来期间计税时按照税法规定可予扣除额0元（1.6 －1.6）。
产生可抵扣暂性差异，如未来期间很可能取得足够的应纳税所得额，则应确认递延所得税资产0.4万元（1.6×25%）：
借：递延所得税资产 4000
贷：所得税费用　4000.
2、以后年度丙公司会计与税务处理。以后年度，无论丙公司是否实现盈利，已确认的递延所得税资产都将转回：
（1）如果2009年实现盈利，则需支付利息2万元（40万元×5%），其中包括或有应付金额0.8万元：
借：财务费用 12000
预计负债 8000
贷：银行存款　20000.
实际支付的预计负债可以在税前扣除，应减少递延所得税资产0.2万元（0.8×25%）：
借：所得税费用 2000
贷：递延所得税资产 2000.
（2）如果2009年未实现盈利，则只需支付利息1.2万元（40×3%），而根据准则，已确认的或有应付金额在随后会计期间没有发生的，企业应冲销已确认的预计负债并确认营业外收入。
丙公司会计处理：
借：财务费用
12000
贷：银行存款　12000
同时：
借：预计负债
8000
贷：营业外收入（债务重组利得）　8000.
预计负债确认时未在税前扣除，冲销时也不应确认为应纳税所得额，所以税法上应调减应纳税所得额0.8万元。预计负债账面价值减少0.8万元，递延所得税资产减少0.2万元：
借：所得税费用
2000
贷：递延所得税资产 2000.