什么样的理由才算是正当理由？依据房地产估价理论，正当理由是指客观的、实际影响存量房价值的因素，如房屋的环境因素、质量因素等。在存量房申报价格评估值产生过程中，税务部门已经考虑了区位、楼层、房型、朝向、建筑年代等明显影响房屋价值的因素。
 
　　除此之外，假如纳税人认为其房产交易价格虽然明显偏低但有正当理由的，可以向主管税务机关提供相关情况，并由主管税务机关研究提出处理意见。