《国家税务总局关于做好2009年度企业所得税汇算清缴工作的通知》（国税函[2010]148号）规定，企业取得的免税收入、减计收入以及减征、免征所得额项目，不得弥补当期及以前年度应税项目亏损；当期形成亏损的减征、免征所得额项目，也不得用当期和以后纳税年度应税项目所得抵补。这条规定要求企业取得的免税项目应该单独核算，应税项目与免税项目不能盈亏相抵。而企业会计利润是综合计算的，没有区分应税项目与免税项目，纳税申报表同样未单独体现应税项目所得与优惠项目所得。因此，计算应税项目的应纳税所得额时，应在会计利润总额的基础上，调减免税项目所得，不管免税项目是盈利还是亏损，都要作全额调减，计算公式为：应税项目调整后所得＝利润总额－免税项目所得。例如，企业应税项目所得为-70万元，免税所得为30万元，利润总额为-40万元，免税所得30万元不得弥补应税项目亏损，应作全额调减，调整后为应税项目的所得仍为-70万元（-40－30）。
　　需要注意的是，原有企业所得税相关法规对此有不同的处理原则，根据《国家税务总局关于企业的免税所得弥补亏损问题的通知》（国税发[1999]34号）的规定，免税项目的所得，可以弥补应税项目当年及以前年度的亏损。
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