上海中医药大学是教育部与上海市人民政府共建高校，上海市重点建设的高水平大学，国家首批世界一流学科建设高校，世界一流中医药大学建设联盟、长三角医学教育联盟创始成员，上海市高水平地方高校建设试点单位，首批世界卫生组织传统医学合作中心，国际标准化组织中医药标准技术委员会秘书处所在地；入选国家“111计划”、卓越医生（中医）教育培养计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、国家“特色重点学科项目”、国家级大学生创新创业训练计划、新工科研究与实践项目、教育部人才培养模式创新实验区、国家理科基础研究和教学人才培养基地、国家大学生文化素质教育基地、中国政府奖学金来华留学生接收院校、上海市首批深化创新创业教育改革示范高校。学校与上海市中医药研究院合署运行。
学校创办于1956年，是新中国成立后国家首批建立的中医药高等院校之一。学校位于浦东新区张江综合性国家科学中心，地处张江科学城核心板块，占地500余亩。在全国第四轮学科评估结果中，中医学、中西医结合、中药学三个一级学科排名全国第一，均取得A+的优秀成绩，是全国中医院校中唯一取得3个A+的高校。
截至2018年5月，学校有14个学院、部、中心，8所附属医院，23个研究所；国家重点学科6个（含培育2个），“双一流”建设学科2个；国家中医药管理局重点学科38个；教职员工近1300人，包括3名两院院士，2名国医大师，2名全国名中医，69名上海市名中医，700多名高级专家和教授；全日制在校学生近8000人。