A. 医疗器械
B. 主要起标识作用的平面设计
C. 动植物新品种的培育方法
D. 智力活动的规则
【解析】(1)选项A：疾病的诊断和治疗方法不能授予专利权，但用于诊断或者治疗疾病的仪器设备可以授予专利权；
(2)选项B：对平面印刷品的图案、色彩或者二者的结合作出的主要起标识作用的设计，不能授予专利权；
(3)选项C：动植物品种不能授予专利权，但动植物品种的生产方法，可以授予专利权；
(4)选项D：智力活动的规则和方法不能授予专利权，但进行智力活动的没备、装置或者根据智力活动的规则和方法而设计制造的仪器，可以授予专利权。
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